Съдържащият циркон естествен силикат ZrSiO4 се нарича циркон (циркон) или зюмбюл (хиацинт), широко разпространен в природата, с разнообразие от красиви цветове от оранжево до червено, от древни времена се смята за скъпоценен камък, казва се, че думата циркон идва от арабската дума Zarqūn, която е цинобър, а също така се казва, че идва от персийската дума Zargun, която е злато, а зюмбюлът идва от гръцката дума „лилия“, а островната държава Шри Ланка в Индийския океан е богати на циркон. Скъпоценните камъни, съдържащи цирконий като форма на циркон, са известни от древни времена.
През 1789 г. германецът MHKlaproth установява, че когато изучава циркона, той е евтектичен с натриев хидроксид, охлаждащата течност се разтваря със солна киселина, към разтвора се добавя калиев карбонат, утайката се филтрира и пречиства и след това утайката се ко- кипва със сярна киселина и след това силициевият оксид се филтрува и калций, магнезий, алуминиевият оксид, който не беше открит, се утаява след добавянето на калиев карбонат към разтвора, тази утайка не се разтваря в луга като алуминиев оксид , нито пък взаимодейства с киселина като магнезиевия оксид, Клапрот смята, че тази утайка е различна от познатите преди това оксиди и е съставена от Zirkonerde (цирконий, немски) и скоро френският химик de Both Morueau и Vauquelin потвърждават правилността на MH Според анализа на Klaproth латинското име на елемента е Zirconium, а символът е Zr, което се превежда като цирконий на китайски.
През 1808 г. британският Х. Дейви използва електрически ток за разлагане на циркониеви съединения, но без успех, през 1824 г. шведът JJ Berzelius за първи път използва калий, за да редуцира K2ZrF6, за да произведе метален цирконий, но не беше достатъчно чист, формулата на реакцията беше: K2ZrF{ {5}}K=Zr + 6KF, реакцията може да се използва и Na като редуциращ агент, до 1914 г., двама изследователи Лели и Хам в завод за производство на нагорещени метални лампи в Брюгер, Холандия използва безводен циркониев тетрахлорид и излишък от натриев метал в празна топка, нагрята с електрически ток при 500 градуса и получава чист метален цирконий.
Напълно чист цирконий е произведен едва през 1925 г. от холандските химици Антон Едуард ван Аркел и Ян Хендрик де Боер чрез разлагане на циркониев тетрайодид (ZrI4). Цирконият се произвежда в големи количества чрез нагряване на циркониев тетрахлорид с магнезий.